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农科院作科所玉米分子育种创新团队提出混合样品分析新策略

    2016年11月03日

    • 上世纪90年代提出的混合分离体分析(bulked segregant analysis)或DNA混池分析(pooled DNA analysis)在遗传学研究?#31995;?#21040;广泛应用。随着高通量测序和分析技术的发展,DNA混池分析大大降低了分析成本,因而得到更为广泛的应用。


          中国农科院作物科学研究所玉米分子育种技术和应用创新团队邹枨、王平喜、徐云碧将DNA混池分析方法扩展为具有普遍适用性的混合样品分析(bulked sample analysis),系统地阐述了适用于混合样品分析的群体、抽样和混合策略、标记类型和鉴定平台、实验设计原则及分析流程。


          玉米分子育种创新团队拓展的混合样品分析方法可用于基因定位、 挖掘和克隆。它不受物种、群体或基因型分析平台的限制,与物种是否具有参考基因组的无关;既可以应于自然群体中,也可以应用于双亲分离群体;混合样品分析适合于不同的基因型鉴定平台,包括单个的分子标记、高密度标记芯片和基于测序的分子标记系统等。混合样品分析可在不同的分子水平上进行,包括 DNA、RNA和蛋白质。研究人员可以从任?#25105;?#20256;或育种群体中采集极端个体,分类后进行混合样品的?#21592;?#20998;析,也可以针对仅存的某种极端类型进行混合样品分析。高通量的基因型鉴定技术与混合样品分析相结合已经成为快速挖掘优良等位基因及变异、开发重要农艺性状分子标记的强大工具。混合样品分析为利用基因组学技术和优异种?#39318;?#28304;,挖掘重要农艺性状基因并应用于作物改良提供了捷径。


           研究结果以《Bulked sample analysis in genetics, genomics and crop improvement》为题在线发表于《植物生物技术杂志(Plant Biotechnology Journal)》。



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